Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM3DQ96BQ1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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