Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms