Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RFKQ969G6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms