Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00337Q8N6G1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms