Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF1Q8N6C5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF1Q8N6C5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms