Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SKAP1Q86WV1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKAP1Q86WV1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms