Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY3Q7L099 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms