Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRINP3Q76B58 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRINP3Q76B58 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms