Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAXIP1Q6ZW49 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAXIP1Q6ZW49 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms