Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms