Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NHSL1Q5SYE7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms