Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms