Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB6CQ53S08 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB6CQ53S08 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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