Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms