Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBR1Q14596 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBR1Q14596 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms