Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DSC3Q14574 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms