Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL4A6Q14031 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms