Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTCH1Q13635 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTCH1Q13635 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
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