Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ATRQ13535 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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