Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXE3Q13461 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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