Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMQ13315 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATMQ13315 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATMQ13315 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ATMQ13315 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATMQ13315 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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