Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PRDM2Q13029 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PRDM2Q13029 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
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