Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC15Q0P6D6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms