Protein–RNA interactions for Protein: Q01955

COL4A3, Collagen alpha-3(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3Q01955 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL4A3Q01955 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL4A3Q01955 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms