Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDK5Q00535 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms