Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2MP61081 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms