Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms