Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRCA2P51587 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BRCA2P51587 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms