Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRPC1P48995 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms