Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTDSS1P48651 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms