Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ARL1P40616 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ARL1P40616 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ARL1P40616 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms