Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PPARGP37231 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PPARGP37231 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms