Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFSF4P23510 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF4P23510 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms