Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C4BPBP20851 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms