Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP4AP20648 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms