Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL2P13500 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms