Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A1P11836 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms