Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB5P09067 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB5P09067 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB5P09067 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB5P09067 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB5P09067 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXB5P09067 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXB5P09067 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB5P09067 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB5P09067 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB5P09067 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB5P09067 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms