Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPLO60437 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPLO60437 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPLO60437 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPLO60437 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPLO60437 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPLO60437 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPLO60437 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPLO60437 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms