Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MARCH6O60337 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms