Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FANCAO15360 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FANCAO15360 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FANCAO15360 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FANCAO15360 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FANCAO15360 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FANCAO15360 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FANCAO15360 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms