Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAV27A0A087WT01 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAV27A0A087WT01 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms