Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms