Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
RAD54L2Q9Y4B4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD54L2Q9Y4B4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms