Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms