Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNRF3Q9ULT6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms