Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF608Q9ULD9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF608Q9ULD9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms