Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP21Q9UK80 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP21Q9UK80 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms