Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS29Q9UBQ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms