Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SAE1Q9UBE0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SAE1Q9UBE0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAE1Q9UBE0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAE1Q9UBE0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAE1Q9UBE0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAE1Q9UBE0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAE1Q9UBE0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAE1Q9UBE0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAE1Q9UBE0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SAE1Q9UBE0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms